
Última actualización: septiembre de 2026
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Facturar no debería ser la parte de tu negocio que más tiempo te roba. Entre crear la factura, mandarla, hacer seguimiento de si se ha pagado y guardar el justificante para cuando toque declarar impuestos, es fácil perder horas al mes en algo que un software bien elegido resuelve en minutos.
En vez de ordenar esta comparativa por marca, la hemos organizado por lo que de verdad decide la elección de la mayoría: cuánto quieres pagar.
Nivel 1: gratis, sin letra pequeña — Zoho Invoice
Zoho Invoice es, de largo, la opción gratuita más completa del mercado: hasta 500 facturas al año sin coste, con plantillas, recordatorios de pago automáticos y portal de cliente incluidos. No es una versión recortada para empujarte a pagar — es una herramienta de facturación funcional de verdad, gratis de forma permanente.
El límite real: el nombre de Zoho aparece en tus facturas gratuitas, y si lo que necesitas ya es contabilidad completa (no solo facturar), tendrás que dar el salto a Zoho Books, que sí es de pago.

Elígelo si: facturas con regularidad moderada y el precio es tu prioridad número uno.
Nivel 1 (alternativa): factura y lleva tus cuentas a la vez — Wave
Wave hace algo poco habitual en este nivel de precio: combina facturación gratuita con contabilidad básica gratuita en la misma herramienta, sin límite de facturas. Solo pagas si usas su procesador de pagos para cobrar con tarjeta, y ahí la comisión es por transacción, no una cuota mensual.
El límite real: la nómina y algunas funciones de soporte están reservadas a complementos de pago.

Elígelo si: además de facturar, quieres llevar tus cuentas sin pagar una suscripción mensual.
Nivel 2: económico y centrado en freelancers — Invoice Ninja
Invoice Ninja ocupa un hueco curioso: es de código abierto, lo que significa que, si quieres, puedes alojarlo tú mismo en tu propio servidor sin pagar nada. Su versión en la nube tiene plan gratuito y un plan Pro de bajo coste con facturas y presupuestos ilimitados, pensado para quien ya ha superado los límites de las opciones 100% gratis.
El límite real: pide algo más de paciencia de configuración que Zoho Invoice o Wave — no es la opción más plug-and-play de esta lista.

Elígelo si: te importa controlar dónde viven tus datos, o ya tienes un volumen de facturación que se queda corto en los planes gratuitos de otros.
Nivel 3: cobra con tarjeta sin complicarte — Square Invoices
Si ya usas Square para cobrar en tienda física o por terminal, Square Invoices es la continuación lógica: factura online con la misma cuenta, mismo panel y mismo histórico de cobros. Tiene plan gratuito, con comisión por cada pago procesado online.
El límite real: fuera del ecosistema Square, no aporta tanto respecto a otras opciones de esta lista — su punto fuerte es precisamente esa integración.

Elígelo si: ya cobras con Square en el día a día de tu negocio y quieres todo en el mismo sitio.
Nivel 4: facturación con todo incluido — FreshBooks
FreshBooks empezó siendo solo software de facturación y fue creciendo hasta convertirse en una herramienta de contabilidad ligera completa — y ese orden se nota: la parte de facturar sigue siendo la más cuidada de toda la plataforma. Incluye seguimiento de horas trabajadas, gastos y informes, todo en un único login.
El límite real: es de pago desde el primer día (sin plan gratuito permanente), y el precio sube si tu número de clientes crece bastante.

Elígelo si: quieres una sola herramienta que haga bien tanto la factura como el resto de tu contabilidad ligera, y no te importa pagar por ello desde el principio.
Nivel 4 (alternativa): gestión completa para quien vive de proyectos — Bonsai
Bonsai va un paso más allá de la factura: incluye contratos, propuestas y seguimiento de tiempo en la misma suscripción, pensado para freelancers y pequeños equipos que gestionan el ciclo completo de un cliente, no solo el cobro final.
El límite real: si solo necesitas facturar, es la opción más cara de toda esta lista para ese único propósito.
Elígelo si: tu negocio implica propuestas y contratos además de facturas, y prefieres una sola suscripción a varias herramientas sueltas.
Resumen por nivel de precio
| Nivel | Herramienta | Coste |
|---|---|---|
| Gratis | Zoho Invoice | 0 € (hasta 500 facturas/año) |
| Gratis | Wave | 0 € + comisión por cobro con tarjeta |
| Económico | Invoice Ninja | Gratis o bajo coste mensual |
| Según uso | Square Invoices | Gratis + comisión por pago online |
| Completo | FreshBooks | De pago desde el inicio |
| Completo | Bonsai | De pago, incluye contratos y propuestas |
La decisión más común para una pequeña empresa que empieza es simple: si el volumen de facturas es bajo o moderado, no hay motivo para pagar nada — Zoho Invoice o Wave cubren de sobra esa necesidad. El salto a una herramienta de pago tiene sentido en el momento en que necesitas algo que el plan gratuito no te da, no antes.